Program Studi S1 Peternakan berdiri sejak tahun 1998 dengan SK Dirjen Pendidikan Tinggi dengan No. 446/DIKTI/Kep/1997 tentang Pembentukan Program Studi S1 Produksi Ternak pada Fakultas Pertanian Universitas UNS, tertanggal 5 Desember 1997.

Mulai tanggal 26 April 2006 Program Studi Produksi Ternak berubah menjadi Jurusan/Program Studi Peternakan (SK Rektor UNS No. 258/J27/PP/2006)

Program Studi Produksi Ternak berubah menjadi Program Studi Peternakan (SK Dirjen Pendidikan Tinggi No 319/D/T/2007).

Program Studi S2 Peternakan berdiri tanggal 18 Desember 2018 (intake 2019)

Pada tanggal 11 Maret 2023 Program Studi Peternakan berdiri menjadi Fakultas Peternakan